工程预算如果是预算结算承包，审计的重点是核查乙方提出的设计变更资料是不是通过了原来设计部门的同意或是经过了甲方的签证，这里的重大设计变更有没有计划或者是主管部门的审批手续，变更工程量的计算是不是真实，套用定额与单价是不是合适且准确，设计变更的增减是不是同步，有没有巧立名目、自行定价、搭车收费的现象。预算加系数或是平方米等价已经承包，审计的重点原则上已经把预算的变动，加价系数等算在内，因此不应该再零星项目变动经济洽谈。如果是招标承包，审计的重点是结算应该按中标合同的标价执行，当然遇到特殊复杂工程可以调价，也要有补充的合同，否则就不应该在 的结算关头再另行加价。
规范的建筑工程预算涵盖工程设计预算、招投标预算、合同签订预算、施工预算和竣工预算，有着完善的预算法规体系，信息化程度不断提高，能适应建筑企业不断变化的内部预算需求，保障企业正常的经营活动，实现资金风险小化、经济效益 化的目标，为企业后续决策提供原始资料。工程预算在核实工程造价，指导建筑项目投资中有不可估量的价值，重视工程预算的规范化建设，是规范项目管理的必要举措，能引导建筑企业深化内部改革，持续改进生产技术和管理流程，挖掘企业发展潜力，树立自己的核心竞争力。建筑工程预算应涉及从项目立项到竣工的全过程，德州工程预算对项目实施期内的每一笔资金都进行记录、审核，用包含事前、事中、事后的动态实时预算工作保障工程质量。当前，我国建筑企业虽已普遍意识到工程预算的重要性，但相关认识不，割裂预算内容，忽视全过程跟踪预算，使得预算变成事后惩处和补救。事后预算无法准确识别项目前中期风险，往往发现错误后才进行查漏补缺，加重建筑企业的损失，预算部门将预算结果作为处罚的主要依据，常常提出强制性整改要求，容易让企业对预算工作产生不满情绪，降低企业对工程预算的认可度和配合度。
这种方法的优点是：审核后的德州工程预算准确度较高；缺点是：工作量大，实质是重复劳动。在投资规模较大。审核进度要求较紧的情况下，这种方法是不可取的，但建设单位为严格控制工程造价，仍常常采用这种方法。这种方法类同于审核法，其与审核法之区别仅是审核范围不同而已。该方法有侧重的，有选择的根据施工图计算部分价值较高或占投资比例较大的分项工程量。如砖石结构（基础、墙体）、钢筋混凝土结构（梁、板、柱）、木结构（门窗）、钢结构（屋架、檀条、支撑）等；而对其他价值较低或占投资比例较小的分项目工程，如普通装饰项目、零星项目（雨蓬、散水、坡道、明沟、水池、垃圾箱）等，审核者往往有意忽略不计，重点核实与上述工程量相对应的定额单价，尤其重点审核定额子自档次易混淆的单价（如构件断面、单体体积），其次是混凝土标号、砌筑、抹灰砂浆的标号核算。这种方法在审核进度较紧张的情况下，常常适用于建设单位审核施工单位的预算或施工单位审核设计单位的预算。这种方法与审核法比较，工作量相对减少，而取得的效果却不是很差，但仍属重复劳动由于上述两种方法类似编制德州工程预算，工作量大，审核周期长，预算人员在长期的工作中摸索出另一种方法，即分析对比审核法。该方法是在总结分析预结算资料的基础上，找出同类工程造价及工料消耗的规律性。结构形式不同、地区不同的工程造价、工料消耗指标。然后，根据这些指标对审核对象进行分折对比，从中找出不符合投资规律的分部分项工程，针对这些子目进行重点审核，分析其差异较大的原因。
工程预算审计以基建项目为标，包括资金来源、基建计划、前期工程、征用土地、勘察设计、施工实施的一切财务收支；工程预算审核以单位工种为标的，只对单位工程预算的合理负责。
审计与工程预算审核是两个截然不同的专业学科，审计以会计师、审计师为主；而工程预算审核以工程经济和工程技术人员为主。目前 正在实行注册造价工程师制度，今后的工程预算审核，将以造价工程师为主。
