工程预算中的工程结算审核，以施工承包合同为基础．以承发包双方发生的实物交易为依据，按照 或地方施工工、料、机消耗标准进行核算，对双方有约束力。其工程结算审核结果可作为双方结算的法律依据。审计定义为：由独立的机构和人员检查被审计单位的会计凭证、会计帐本、会计报表以及其他与财政收支、财务收支有关资料和资产，监督财政收支、财务收支是否真实、合法和有效的行为。审计的目的是加强对公有制投资者资金进行有效的控制，减少投资者滥用职权截留资金，转移资金于小金库，造成建设资金流失，实施违法违规行为。其职能是一种监督行为。
严防利用分包工程项目之间交叉施工内容，多家分头重复计算工程预算和虚增变更签证。一个总承包工程，往往由多家分包单位施工，有些分包单位利用两个或几个单位交叉施工，或利用分包工程结算项目较多，结算力量薄弱，不清楚现场施工情况，对现场变更签证辨别力差等原因，分头多计工程量和现场变更签证，造成工程量计算重复叠加，骗取额外工程价款。分包工程材料费的审计。对分包工程材料费的审计，重点是对分包工程材料的使用情况和费用计算进行审计。掌握分包工程材料使用情况。将分包单位领用的甲供材料数量与预算分析用量及施工图纸设计量进行分析对比，严防甲供材料的超领和浪费，只有杜绝建筑材料的浪费，才能确保总承包方的经济效益。
工程预算的作用：
1.工程预算是施工企业与建设单位结清工程费用的依据；
2.工程预算是施工企业考核工程成本，进行经济核算的依据；
3.工程预算是编制概算定额和概算指标的依据。
工程预算的进行一般分为6个步骤：
1、熟悉招标相关文件与图纸
2、查询材料报价
3、确定劳务价格
4、工程量计算
5、组好综合单价
造价偏差管理（1）偏差预测：对项目进行中可能出现的偏差因素进行预测与分析。（2）检查与计算：对项目一定进度条件下的造价进行计算与检查，得出检查当时条件下的造价。（3）对比：对项目已完工程的预算造价与实际造价进行对比，发现造价偏差，计算出偏差值。（4）分析：对比较的结果进行分析，确定偏差幅度并找出偏差产生的原因。（5）纠偏：根据项目的具体情况和偏差分析结果，建议或采取适当的措施，使造价偏差控制在允许的范围以内或进行项目总造价目标的调整。
工程预算审计另一方面这种造价确定方法，在进行造价确定的过程中主要采用所规定的取费比例与取费计算方法进行造价计算。规定的取费比率和取费计算方法往往不够科学，不利于准确的进行造价确定和开展公的市场竞争。为此必须对这种造价确定方法加以改变，对工程造价方法进行科学的分析与研究。