工程审计是控制工程预算的有效措施，它可以提高工程资金的使用效率，对整个工程项目起到了监督检查的作用。随着经济的快速发展，我国开展的大型工程也相应的增多，工程项目审计在工程建设经济活动中起了越来越重要的作用。我国在工程审计中也相应地借鉴了国外的一些先进的技术，通过科学有效的创新管理，不断的丰富工程审计的项目和类型，推动了我国工程建设方面的重大发展。接下来我们具体讨论工程审计在工程预算控制中的有效作用。
履约保函的作用是保证承包商能按合同规定承担工程的实施和完成及其缺陷修复的银行担保，其有效期至业主向承包商颁发交工之日。工程预算承包商应按在规定的期限内向业主提交履约保函，未提交之前不得对其计量。动员预付款保函的作用是对业主支付给承包商用于开工前准备工作启动资金的银行担保，按工程进度以一定比例分期从各月的中期支付中扣回。其有效期至全部扣回之日起失效。承包商应按在规定的期限内向业主提交动员预付款保函，未提交之前不得支付动员预付款。
编制标底应以设计图纸为依据，标底价格及工期的计算应执行 或地区所颁发的概(预)算定额和有关规定。人工、机械、台班及材料价格的变动因素，施工不可预见费或包干系数以及工程需要增加的措施费等应列标底；标底是否正确首先取决工程量表是否正确，因而在工程量表中要尽量减少漏项，并尽可能计算无误，力争计算工程量的误差控制在实际工程量的±5%以内，以防止加漏项和工程量差别太大而引起的索赔；标底是由主业主组织专门人员为准备招标的那一部分工程或设备，或工程和设备都有而计算出的一个合理的基本价格。新疆工程预算它不等于工程(或设备)的概预算，也不等于合同价格。标底是招标单位的绝密资料，不能向任何元关人员泄漏。我国国内大部分工程在招标评标时，均以标底上下的一个幅度(5%-10%)为判断投标是否合格的条件。标底一般是以概预算为基础编制的，标底价:包括招标工程总预算，单元预算，钢材、木材、水泥总用量及其单方用量，其中没有三材指标而需要议价采购的应注明其数量、单位价差及差价总金额，招标工程总预算中的所含各项费用的说明，包括包干系数或不可预见费用的说明和工程特殊技术措施费的说明。
严防利用分包工程项目之间交叉施工内容，多家分头重复计算工程预算和虚增变更签证。一个总承包工程，往往由多家分包单位施工，有些分包单位利用两个或几个单位交叉施工，或利用分包工程结算项目较多，结算力量薄弱，不清楚现场施工情况，对现场变更签证辨别力差等原因，分头多计工程量和现场变更签证，造成工程量计算重复叠加，骗取额外工程价款。分包工程材料费的审计。对分包工程材料费的审计，重点是对分包工程材料的使用情况和费用计算进行审计。掌握分包工程材料使用情况。将分包单位领用的甲供材料数量与预算分析用量及施工图纸设计量进行分析对比，严防甲供材料的超领和浪费，只有杜绝建筑材料的浪费，才能确保总承包方的经济效益。
